本作围绕着高中生的日常生活，讲述了在“炼金术”盛行的时代中，青年人们为了守护正义、追逐梦想，而勇敢对抗邪恶势力的故事。
炼金术本来指的是尝试从普通金属中提炼黄金的技术，随着科技发展，炼金术士们尝试将人类的肉体和精神作为对象，加以熔炼。汇集这种炼金术的精华而创造出来的，就是完全的人工生命体，101只“凯米”。
可是原本应该被封印在“凯米卡”里的凯米突然被释放了，探求梦想的高中生一之濑宝太郎偶然目击了这一过程，从此被卷入了这场风波中。他与凯米相遇，结识神秘的女同学九堂凛音，还被托付了变身腰带。
一之濑宝太郎决心保护凯米不被邪恶势力利用，并立志要与凯米成为同伴。于是他和朋友们一起变身为假面骑士，开始了追逐梦想的旅途，一群青涩懵懂的高中生也逐渐成长。
