回顾泽塔奥特曼和迪迦奥特曼的英雄事迹。泽塔奥特曼是赛罗奥特曼的徒弟，拥有着和赛罗一样的热心肠，是一位非常积极向上的奥特英雄。而且，泽塔非常崇拜他的师父赛罗。赛罗虽然嘴上不承认这个徒弟，但其实心里还是很看好泽塔的。这次和泽塔奥特曼有关的人类，是一位名叫夏川遥辉的热血青年。遥辉是怪兽应对机甲部队“军械库”的一名队员。21世纪初期，地球不再有侵略和战争，人类期盼已久的和平终于到来了。地球防卫军组织也因此完成了历史使命，TPC(地球和平联合)组织成立，人类迎来了新的的时代。但是，在实现世界性非武装化的2007年，地球又突然出现了怪兽。大古队员全身被光所包围，并融身于剩下的1座巨像内，迪迦奥特曼在现代复活了！迪迦的故事随之展开。
